Хорошо разработанный протокол эпигенетического тестирования может выявить больше, чем просто количество дней рождения, которые кто-то отпраздновал. Объединив данные о метилировании ДНК с машинным обучением, современные модели тестирования позволяют оценить, насколько быстро организм может стареть.
Хорошо разработанный протокол эпигенетического тестирования может выявить больше, чем просто количество дней рождения, которые кто-то отпраздновал. Объединив данные о метилировании ДНК с машинным обучением, современные модели тестирования оценивают, насколько быстро тело может стареть на молекулярном уровне. Настоящая задача состоит не в том, чтобы получить оценку возраста, а в том, чтобы получить такую оценку, которая останется точной для разных образцов, лабораторий, групп населения и дат тестирования.
Как работает протокол эпигенетического тестирования
Эпигенетическое тестирование — это измерение химических модификаций, которые регулируют активность генов без изменения базовой последовательности ДНК. Большинство тестов на биологическое старение исследуют метилирование ДНК, которое происходит, когда метильные группы прикрепляются к основаниям цитозина в геномных местах, называемых сайтами CpG.
Типичный лабораторный и вычислительный рабочий процесс включает в себя:
Сбор проб: Образцы крови, слюны или клеток щеки собираются в контролируемых условиях.
Экстракция ДНК. Геномную ДНК выделяют и проверяют на концентрацию, чистоту и деградацию.
Обнаружение метилирования: преобразование бисульфита, микрочипы или секвенирование позволяют количественно оценить метилирование в выбранных сайтах CpG.
Контроль качества: зонды низкой достоверности, загрязненные образцы и технические средства.